Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Med27Q9DB40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med27Q9DB40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms