Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tmem239Q9DA47 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmem239Q9DA47 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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