Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D9H8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9D9H8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms