Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rexo2Q9D8S4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms