Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q9D8Q6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms