Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp4bQ9D8B3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp4bQ9D8B3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms