Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms