Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn9Q9D805 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn9Q9D805 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms