Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pfn4Q9D6I3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms