Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra4Q9D6F4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra4Q9D6F4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra4Q9D6F4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra4Q9D6F4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra4Q9D6F4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms