Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PudpQ9D5U5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PudpQ9D5U5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms