Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4f1Q9D5Q6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms