Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sf3a3Q9D554 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms