Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc130Q9D516 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms