Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms