Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Efhd1Q9D4J1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Efhd1Q9D4J1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms