Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd1Q9D4C1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd1Q9D4C1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms