Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms