Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D3J9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D3J9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D3J9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms