Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trappc6bQ9D289 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc6bQ9D289 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6bQ9D289 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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