Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Batf3Q9D275 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms