Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chchd2Q9D1L0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms