Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyc1Q9D0M3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyc1Q9D0M3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms