Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl55Q9CZ83 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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