Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2fQ9CY34 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms