Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms