Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd8Q9CX56 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmd8Q9CX56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms