Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pin4Q9CWW6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pin4Q9CWW6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms