Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atxn3Q9CVD2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atxn3Q9CVD2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms