Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MINDY3Q9CV28 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms