Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms