Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a2Q9CTG6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a2Q9CTG6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms