Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CR55 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CR55 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CR55 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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