Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4931417E11RikQ9CR05 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4931417E11RikQ9CR05 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms