Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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