Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudt21Q9CQF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudt21Q9CQF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms