Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab5aQ9CQD1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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