Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ubl4bQ9CQ84 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ubl4bQ9CQ84 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ubl4bQ9CQ84 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms