Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpa3Q9CQ71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms