Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms