Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms