Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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