Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cox6cQ9CPQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms