Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms