Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms