Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brms1Q99N20 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brms1Q99N20 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms