Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkd1Q99MH6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkd1Q99MH6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms