Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdca3Q99M54 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms