Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chst12Q99LL3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chst12Q99LL3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms