Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnpo2Q99LG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms